דלקת המוח באבעבועות רוח היא מחלה זיהומית-אלרגית חמורה. דלקת המוח באבעבועות רוח מתפתחת ביום השלישי-שביעי לאחר הופעת הפריחה. לעיתים רחוקות, דלקת המוח מתרחשת במועד מאוחר יותר או בתקופה שלפני הפריחה. מתרחשים היפרתרמיה, תרדמת, עוויתות, תסמיני קרום המוח, הפרעות פירמידליות ואקסטראפירמידליות.