טיפול דיאטתי הוא הבסיס לטיפול באלרגיות למזון. הנקה עם האם על פי תזונה היפואלרגנית היא אופטימלית לילדים עם אלרגיות למזון. אם לאם אין חלב והיא אלרגית לחלב פרה, משתמשים בפורמולות סויה (אלסוי, בונאסויה, פריסוסוי וכו'). במקרה של אי סבילות לסויה, משתמשים בפורמולות המבוססות על מוצרים של הידרוליזה עתירת חלבון (אלפאר, אלימנטום, פפטי-ג'וניור וכו') והידרוליזה חלקית של חלבון חלב (הומאנה, פריסופפ).