בעבר, השתלת מח עצם (BMT) או השתלת תאי גזע המטופויאטיים (HSCT) בחולים עם מחלת גרנולומטוטית כרונית לוותה בשיעור כישלון גבוה למדי. יתר על כן, הדבר היה קשור לעיתים קרובות למצב לא מספק של חולים לפני ההשתלה, ובפרט, לזיהום פטרייתי, אשר, כידוע, יחד עם GVHD, תופס את אחד המקומות המובילים במבנה התמותה לאחר ההשתלה.