דיספפסיה פרנטרלית קשורה למחלות חריפות מחוץ למערכת העיכול (פתולוגיה של מערכות הנשימה, הלב וכלי הדם, השתן ומערכות אחרות), כאשר מערכת העיכול מושפעת משיכרון, היפוקסיה, הפרעות במחזור הדם, שינויים במערכת העצבים המרכזית ובמערכת העצבים האוטונומית, תנועתיות לקויה ותפקוד לקוי של המעיים.