אבחון שעלת מבוסס על שיעול עוויתי טיפוסי עם חזרות, כיח של ליחה צמיגה, לעיתים קרובות עם הקאות בסוף ההתקף, ונפיחות בפנים. ניתן לזהות כיב על פרנולום הלשון. חשיבות רבה לאבחון הם השינויים העוקבים בתקופות המחלה: נזלת, עווית, רזולוציה ושינויים המטולוגיים: לויקוציטוזיס ולימפוציטוזה בולטים עם ESR תקין.
שעלת נגרמת על ידי B. pertussis - מוטות קטנים של גרם-שליליים (קוקובקטריה). יש להם קפסולה עדינה, הם נייחים, אירוביים לחלוטין, רגישים מאוד להשפעות חיצוניות: אור שמש ישיר הורג תוך שעה, חומרי חיטוי - תוך מספר דקות, מייצרים אקסוטוקסין (רעלן שעלת, גורם מגרה לימפוציטוזיס).
כולרה מאובחנת על סמך התמונה הקלינית, המצב האפידמיולוגי ותוצאות בדיקות מעבדה. לשיטה הבקטריולוגית יש חשיבות מכרעת: מיקרוסקופיה של תכשירים ביולוגיים (צואה, קיא וכו') וזריעת החומר על מצע צבירה (מי פפטון, אגר אלקליין).
הגורמים לכולרה קלאסית (biovar vibrio cholera) ולכולרה אל טור (biovar vibrio cholera el tor) אינם שונים זה מזה בתכונות מורפולוגיות, תרבותיות וביוכימיות. מדובר במוטות פולימורפיים גרם-שליליים, מעוקלים או ישרים עם שוטון ארוך, המספק ניידות פעילה.
כולרה היא זיהום מעיים חריף הנגרם על ידי ויבריו כולרה, המאופיין בדלקת גסטרואנטריטיס עם התייבשות מהירה של הגוף עקב אובדן מים ואלקטרוליטים עם הקאות וצואה רכה.
חיידק טיפוס, או סלמונלה טיפי, שייך למשפחת האנטרובקטריה, הוא גרם-שלילי, אינו יוצר נבגים או כמוסות, הוא נייד, גדל היטב על מצע תזונתי קונבנציונלי, במיוחד עם תוספת מרה, והוא אנאירובי פקולטטיבי.
