אצל גברים, נוגדנים נגד זרע נוצרים כתוצאה מתגובה אוטואימונית לאפיתל הזרע. גורמים אטיולוגיים התורמים להתפתחות תגובה כזו כוללים טראומה באשכים, זיהומים חיידקיים וויראליים, ניתוחים באשך (לדוגמה, לאחר כריתת צינור הזרע, נוגדנים נגד זרע מתגלים אצל כל הגברים), ובמקרים מסוימים לא ניתן לקבוע את הסיבה.