קביעת נוגדנים לחלק המיקרוסומלי של בלוטת התריס משמשת לאבחון דלקת בלוטת התריס האוטואימונית והיפותירואידיזם, שבהן רמת הנוגדנים בדם עולה. נוגדנים למיקרוזומים של בלוטת התריס יוצרים קומפלקסים חיסוניים על פני התאים, מפעילים לימפוציטים משלימים וציטוטוקסיים, מה שמוביל להרס תאים ולהיווצרות תהליך דלקתי בבלוטת התריס.