גידולי שלפוחית השתן ב-98% מהחולים מתפתחים מתאי אפיתל, והצורה הנוזולוגית העיקרית של המחלה (יותר מ-90% מהמקרים) היא קרצינומה של תאי מעבר של שלפוחית השתן.
לגידולים באגן הכליה ובשופכן יש עדיין סיבות לא ידועות. עישון הוא גורם סיכון המגביר את הסיכון לפתח קרצינומה של תאי מעבר בדרכי השתן העליונות פי 3. כ-70% מהגברים ו-40% מהנשים שחולים הם מעשנים.