השיטה מבוססת על גילוי אנטיגנים של כלמידיה טרכומטיס בגרגירים מהשופכה, תעלת צוואר הרחם והלחמית באמצעות שיטת ELISA עם הערכה ויזואלית של התוצאה (רגישות - יותר מ-79%, ספציפיות - יותר מ-95%). שיטה זו מבוססת על נוכחות של אנטיגן ליפופוליסכריד ספציפי לסוג בכלמידיה.
נוגדני IgM מתגלים בתקופה האקוטית של הזיהום (כ-5 ימים לאחר הופעתו). שיא נוגדני ה-IgM מתרחש בשבוע הראשון-שני, לאחר מכן יש ירידה הדרגתית בטיטר שלהם (ככלל, הם נעלמים לאחר 2-3 חודשים גם ללא טיפול). נוגדני IgM מכוונים נגד ליפופוליסכריד והחלבון העיקרי של הממברנה החיצונית של הכלמידיה.
נוגדנים מסוג IgM ל-Chlamydia pneumoniae, אשר נוצרים במהלך זיהום ראשוני ומאשרים את האבחנה האטיולוגית של המחלה אפילו במחקר בודד, ניתנים לזיהוי בתגובת אימונופלואורסצנציה עקיפה או ELISA (רגישות - 97%, ספציפיות - 90%).
גונוקוקים גורמים לדלקת מוגלתית של מערכת המין - זיבה. הקושי בגילוי שלהם הוא הכדאיות החלשה שלהם, שאינה מאפשרת שימוש נרחב בשיטה הבקטריולוגית (היא נותנת תוצאות חיוביות ב-20-30% מהמקרים).
השיטה הסרולוגית הנפוצה ביותר לאבחון הליקובקטר פילורי היא שיטת ELISA. השיטה אינה פולשנית ועקיפה: נוגדנים להליקובקטר פילורי, המסווגים כ-IgA, IgM ו(לרוב) IgG, נקבעים בדם המטופל.
בדיקת ELISA מאפשרת לזהות נוגדנים מסוג IgM ו-IgG ללפטוספירות. ניתן לזהות נוגדני IgM בדם ביום הרביעי-חמישי למחלה, טיטר הנוגדנים שלהם מגיע לשיא בשבוע השני-שלישי, ואז יורד במהלך החודשים.
ELISA היא שיטה רגישה וספציפית יותר לאבחון טולרמיה, המאפשרת גילוי נוגדנים מסוג IgA, IgM ו-IgG. גילוי נוגדנים מסוג IgM או עלייה פי 4 בטיטר ה-IgG מאשר זיהום חריף או זיהום חוזר בנוכחות התמונה הקלינית המתאימה של המחלה.
במחלת ליים, נוגדנים ספציפיים ל-IgM מופיעים בדרך כלל בדם 2-4 שבועות לאחר הופעת אריתמה מיגרנס, כאשר שיא הנוגדנים מתרחש בשבועות 6-8 של המחלה. בשלב 1, נוגדני IgM מזוהים ב-40-60% מהחולים.
קביעת טיטר הנוגדנים לפתוגן הפסאודו-שחפת בסרום היא שיטה רטרוספקטיבית לאבחון פסאודו-שחפת. נבדקת סרום מזווג של המטופל. כדי לזהות נוגדנים ספציפיים, נלקחת דם לבדיקה בתחילת המחלה ו-7-10 ימים לאחר הבדיקה הראשונית.