נגיף הפפילומה האנושי מהווה איום רציני. אבחון נחוץ כדי לקבוע את זן הזיהום ואת הסיכון לאונקוגניות שלו. מידע כזה מאפשר לנו לגבש את תוכנית הטיפול המתאימה והיעילה ביותר.
PCR מאפשר לקבוע את נוכחות ה-DNA של גונוקוקים באופן ישיר ולבטא כמותית את ריכוזו בחומר הנחקר. החומר הנחקר יכול להיות כיח, נוזל שטיפה, שתן, דקירות מאיברים שונים וציסטות וכו'.
בניגוד לשיטות סרולוגיות לאבחון זיהום בשחפת, המזהות נוגדנים ל-Mycobacterium tuberculosis, PCR מאפשר זיהוי ישיר של DNA של Mycobacterium tuberculosis וביטוי כמותי של ריכוזם בחומר הבדיקה.
לאחרונה, נעשה שימוש בזיהוי DNA של HSV 1 ו-2 בחומר משלפוחיות וכיבים של העור או הריריות (כולל הלחמית של העין) באמצעות שיטת PCR (שיטת אבחון רגישה, ספציפית ומהירה מאוד) לאבחון זיהום הרפס.
קביעה כמותית ישירה של RNA של HIV באמצעות PCR מאפשרת ניבוי מדויק יותר של קצב התקדמות המחלה אצל אנשים נגועי HIV מאשר קביעת ספירת תאי CD4+, ולכן הערכה מדויקת יותר של הישרדותם. ספירת חלקיקים נגיפיים גבוהה בדרך כלל מתואמת עם פגיעה חמורה במערכת החיסון וספירת תאי CD4+ נמוכה.
