האבחון הקליני של כל צורה של זיהום Hib, למעט דלקת האפיגלוטיטיס, הוא משוער, מכיוון ש-Hib הוא הגורם הסיבתי הנפוץ ביותר שלו. האבחנה של זיהום Hib נקבעת על סמך בידוד של תרבית המוקלצ'ר של הפתוגן ותרבית של הפרשות פתולוגיות (נוזל מוחי שדרתי, מוגלה, תפליט פלאורלי, כיח, מריחות מהאף והלוע).