כאשר רקמות החניכיים מושפעות מזיהום, הדלקת שלהן מתפתחת עם היווצרות נפיחות - דלקת חניכיים בצקתית או צורה בצקתית של דלקת חניכיים היפרטרופית, שבה יש עלייה מוגזמת ברקמות הרכות של החניכיים - האפיתל של צוואר השיניים ורירית הפפילות הבין-שיניות.
דלקת חניכיים היפרטרופית פיברוזית היא מחלה דלקתית כרונית המלווה בגדילה תגובתית של יסודות רקמת חיבור סיביים ומבנים בסיסיים של אפיתל החניכיים מבלי לפגוע בשלמות החיבור הדנטו-חניכי.
פיסטולה על החניכיים יכולה להופיע מסיבות שונות, אך לרוב מדובר בסיבוך של תהליך דלקתי בחניכיים, באזור חלל הפה, השן. לעתים קרובות פיסטולה מתרחשת כאשר שן בינה בוקעת, או במקרה של עששת מוזנחת.
